جمهوری خودگردان یا جمهوری خودمختار نوعی از حکومت است که در آن، یک ملت به دلایلی از جمله دور افتادگی از مرکز کشور، اختلاف فرهنگی با بقیه جمعیت کشور و یا دلایل سیاسی از جمله مبارزات استقلال طلبانه؛ اعلام خودمختاری می‌کنند. در واقع بخشی از یک کشور مستقل، خود اعلام استقلال می‌کند اما نه به طور رسمی و شناخته‌شده توسط سایر کشورها و دولت‌های مستقل.