بایقونور (به قزاقی: Байқоңыр) شهری در استان قیزیلاوردا کشور قزاقستان است که در سرشماری سال ۲۰۰۸ میلادی، ۵۹۴۵۲ نفر جمعیت داشته است و از سال ۱۹۶۹ میلادی بهعنوان شهر شناخته میشده است.