Autokefalna Crkva (grč. autos = sam, kefale = glava) naziv je u pravoslavnim i u istočnim pravoslavnim Crkvama, za samostalnu Crkvu koja ne zavisi od neke druge crkvene vlasti.
Svaki pravoslavni narod, ukoliko je kao dominantan na jednoj teritoriji stekao državnu nezavisnost, po pravilu ima pravo oformiti sopstvenu autokefalnu Crkvu.
Na čelu neke autokefalne pravoslavne Crkve je obično patrijarh, a ponegdje arhiepiskop i/ili mitropolit.